生命科学与环境资源
徐美, 高榆嘉, 徐田田, 许云舒, 陈丽华, 许青松
大连民族大学学报.
2024, 26(5):
385-389.
为了充分挖掘南方红豆杉功能基因,开发利用其生物资源。选用PacBio Sequel第三代测序技术,对贵州省梵净山地区的南方红豆杉植株进行转录组测序,开展生物信息学分析。共获得68.03 Gb原始数据,包含1 001 302条原始序列读取片段。经组装、拼接、去冗余后获得65 152条单基因簇(Unigene),平均长度为2 591 bp。与已有数据库比对显示,南方红豆杉参与细胞和代谢活动的基因表达量较高,具有较强的代谢活动和遗传信息处理能力,转录组中与生长发育、抗逆、次生代谢和合成相关的转录因子,为全面开发南方红豆杉和遗传育种提供数据支持。